督察指出，福建省在生態環境保護方面雖然取得重要進展，但在處理發展與保護關系時仍面臨不少問題。有的地方和部門對當地環境質量存在盲目樂觀情緒，為應對督察，漳州市臨時將盆栽苗木擺放在應開展生態恢復的場地，把草皮直接鋪設在混凝土地面上，明目張膽弄虛作假。

廈門大量污水直排

督察指出，個別地方和部門漠視群眾訴求，群眾反映強烈的三明永安市尼葛省級開發區臭氣擾民問題久拖不決，嚴重影響周邊居民正常生活。廈門市污水處理能力建設長期滯后，大量污水直排，嚴重影響近岸海域水質。

寧德市為了給建設項目騰出空間，于2012年、2015年兩次擅自違規調整環三都澳濕地水禽紅樹林自然保護區范圍和功能區劃，導致自然保護區面積銳減至2442.64公頃，縮減94%。三明市黨委政府和省住房城鄉建設、自然資源等部門依法履行環境保護管理職責不到位，為永安金銀湖水泥有限公司兩個灰巖礦保留采礦權找理由、開口子，對桃源洞—鱗隱石林國家重點風景名勝區生態保護造成較大影響。

縣政府蓄意作假 偽造專題會議紀要

督察發現，一些地方和部門在督察整改時敷衍應付。漳州市華安縣政府及相關部門對群眾投訴的漳州友利石墨有限公司廢氣長期超標排放問題敷衍應對，任由污染問題長期存在。此次督察發現，該企業廢氣仍超標排放，甚至利用滲坑排放強酸性廢水。為應對督察，華安縣政府還偽造專題會議紀要，蓄意作假，性質惡劣。

福州市閩侯縣政府對企業弄虛作假問題監管不力，閩信建材公司2018年上報已完成生物質鍋爐改造并領取政府鍋爐改燃補助資金，但為降低成本仍在大量使用燃煤，鍋爐污染問題并未解決。現場檢查時，為掩蓋長期燒煤事實，企業臨時將生物質顆粒燃料覆蓋在煤堆上，企圖蒙混過關。

違規填海造地導致生態系統功能退化

督察發現，一些地方和部門對重要海洋功能區保護不力。福建定海灣實業有限公司擅自改變用海方式，違法建設連江定海灣山海運動休閑項目，但2016年以來，福建省發展改革、海洋與漁業部門先后將其確定為福建省重點項目和海洋經濟重大項目，福州市將其列入第一批市級特色小鎮創建名單。

2017年4月，漳州市古雷港經濟開發區管委會為推動古雷煉化一體化項目建設，在未取得用海手續情況下，擅自委托福建漳龍建投集團有限公司實施違法填海項目，侵占東山灣濕地，截至2018年10月，共填海造地5820畝。2012年至2019年，南安市水頭鎮巷內村持續在南安市安海灣海域違法填海，侵占大盈溪河口濕地500多畝，導致局部生態系統功能嚴重退化，近岸海域水質明顯惡化。泉州市政府在未經上級海洋部門批準的情況下，多次試圖通過調整海洋功能區劃使上述違法圍填海行為合法化。