古樹名木保護是生物多樣性保護工程重要內容之一，是生態文明建設重要組成部分。根據《昆明市古樹名木保護管理辦法》和普查要求，2017年，陽宗海風景名勝區對轄區內古樹名木開展專項摸底，下撥專項資金開展保護工作，為古樹名木建立保護信息，詳盡記錄樹種、樹齡、胸徑、冠幅、生長環境，做到“一樹一檔”“一樹一策”，制定相應管理措施，安排專人管護。目前，陽宗海風景名勝區記錄有古樹名木363棵。其中，一級古樹名木19棵，二級古樹名木40棵，三級古樹名木304棵，樹種為黃連木、柏木紫薇、滇樸等。