據南京農業大學園藝學院副教授王海濱介紹，菊花黑斑病在種植時間較久的花田比較常見，主要是影響葉片。前期發病基本可以控制。但經驗則極易產生嚴重的后果，可能會造成絕收。

南京農業大學菊花遺傳育種與分子生物學實驗室陳發棣教授領銜的研究團隊，在國家自然科學基金，江蘇省自然科學基金、中央高校基本科研業務費等項目的資助下，以抗病和感病的菊花品種為研究對象，在病菌侵染早期（未形成病斑階段），侵染中期（病斑形成階段）和侵染后期（病斑擴展蔓延階段），對菊花葉片取樣，通過高通量測序鑒定了一系列菊花響應黑斑病菌侵染的差異表達基因，在高通量測序分析的基礎上，結合權重基因共表達網絡分析、熒光定量PCR和菊花遺傳轉化實驗，繪制了菊花響應黑斑病菌侵染的免疫時序圖。

研究發現，在病菌侵染早期，鈣信號、EDS1介導的免疫反應被激活；隨著病斑的形成，更多的植物免疫反應發揮作用，尤其是乙烯信號介導的免疫反應；在侵染后期，鑒定了一系列菊花免疫反應的核心基因，包括多藥抗性蛋白，豐富了菊花抗病分子機理。

據陳發棣教授介紹：菊花黑斑病的典型癥狀是：發病初期葉片上零星分散著很小的、褐色的壞死斑點，隨后病斑逐漸擴大，形成圓形、橢圓形或不規則形的黑色病斑，并會出現同心環一樣的輪紋。受侵染植物的生長通常受到抑制，花朵也會變小、變少，而且花型扭曲，導致干枯、脫落甚至死亡，給生產造成嚴重損失。“菊花黑斑病在高溫高濕的環境下，危害尤為嚴重。該研究明確菊花抗黑斑病的機理，可為黑斑病抗性育種和有效防治提供理論指導。”陳發棣教授說。

2020年3月，《園藝研究》在線發表了該團隊題為“通過對感染黑斑病的菊花葉片的基因表達圖譜分析，揭示了其防御機制的不同階段”的研究論文�！秷@藝研究》是由南京農業大學與Nature出版集團合作創辦的英文期刊，是Nature旗下唯一一本園藝領域�？�，也是目前園藝領域唯一一本一區中國SCI期刊。