近年來，我省將種苗產業作為實施千億級果業產業的重要抓手，多措并舉，在果樹育種上加大投入，選育出了一大批自主品牌的新優品種，如秦脆蘋果、秦蜜蘋果、瑞陽蘋果、瑞雪蘋果、金艷獼猴桃、華優獼猴桃等。實施育繁推一體化種苗繁育工程，在蘋果、獼猴桃基地縣新建一批育苗基地，年產能達到5000萬株，確保新建園布局新優品種、改造園優質接穗，支撐果業品種升級換代。據統計，截至2018年年底，全省共有果樹苗木生產基地近3萬畝，各類果樹苗木總量1.2億株；2019年，可出圃苗木6000余萬株，其中，蘋果苗4500萬株。千陽、白水、臨渭、扶風及楊凌一帶是我省果樹苗木的集中產區。

隨著大量社會資本介入，我省苗木繁育不斷向企業化、專業化、規模化、標準化發展，形成了個體、合作社、企業共存的局面。壓條繁育、嫩枝扦插、組織培養等育苗技術已在全省廣泛應用。至2018年年底，我省在冊登記的果樹育苗企業有80余個，其中苗木基地面積1000畝以上的企業5個，500畝以上的企業8個，11家開展種苗組培快繁生產，22家采購了起苗機械并建成貯存冷庫。陜西海棠生態農林有限公司在組培育苗上走在全國前列。陜西的各類苗木，尤其是脫毒苗、矮化苗、帶分枝苗暢銷全國果區。